Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GDE1Q9NZC3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms