Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LHX9Q9NQ69 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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