Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PHACTR1Q9C0D0 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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