Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VN1R3Q9BXE9 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms