Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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MEIS3Q99687 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MEIS3Q99687 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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