Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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