Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHCHD4Q8N4Q1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHCHD4Q8N4Q1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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