Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM43BQ6ZT52 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms