Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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KNOP1Q1ED39 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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KNOP1Q1ED39 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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KNOP1Q1ED39 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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KNOP1Q1ED39 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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