Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms