Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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