Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC85BQ15834 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC85BQ15834 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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