Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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