Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD1Q15797 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms