Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TTF1Q15361 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TTF1Q15361 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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