Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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