Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC3Q15034 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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