Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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