Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCN5AQ14524 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN5AQ14524 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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