Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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