Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PDE6HQ13956 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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