Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EXOSC2Q13868 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.6 ms