Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1Q13813 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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