Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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