Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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