Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SF3B2Q13435 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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