Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATMQ13315 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATMQ13315 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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