Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NME3Q13232 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NME3Q13232 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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