Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF3Q13114 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAF3Q13114 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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