Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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CNTN1Q12860 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CNTN1Q12860 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNTN1Q12860 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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