Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CPSF1Q10570 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
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