Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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