Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms