Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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