Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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LRRTM2O43300 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LRRTM2O43300 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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