Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms