Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP4Q9P0V3 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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