Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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