Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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