Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF548Q8NEK5 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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