Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM43BQ6ZT52 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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FAM43BQ6ZT52 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM43BQ6ZT52 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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