Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FXNQ16595 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
FXNQ16595 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FXNQ16595 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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