Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZFHX3Q15911 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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ZFHX3Q15911 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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ZFHX3Q15911 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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ZFHX3Q15911 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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