Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAMP3Q15836 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAMP3Q15836 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms