Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD1Q15797 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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