Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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