Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HERPUD1Q15011 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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