Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CAPRIN1Q14444 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPRIN1Q14444 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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