Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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