Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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